Dans le monde entier, la pollution des eaux peut être industrielle, agricole et domestique. Ces atteintes dégradent la qualité de l'eau mais ont aussi de graves déséquilibres environnementaux au sein des écosystèmes, qui peuvent constituer une menace importante pour la santé des populations.

L'emploi des pesticides et des fertilisants dans le domaine de l'agriculture a diminué mais les concentrations de... jadis sont tenaces et polluent les nappes phréatiques.

Les eaux usées provenant du secteur de l'industrie ou de l'urbanisation contribuent aussi aux taux excessifs de phosphates et autres composés organiques responsables de l'eutrophisation des eaux de surface. 

En dépit des directives européennes, qui ont permis de réduire ces pollutions, leur niveau reste trop élevé dans de nombreuses zones. Il en va de même pour les rejets de NOx et de SO2 dans l'atmosphère qui sont à l'origine des pluies acides. Malgré les réglementations, la dose critique reste dépassée dans diverses régions.

Des particules d'argile en suspension qui forment une éponge absorbante capable de récupérer des bactéries et des molécules, qui peuvent proliférer dans le milieu aquatique. Il y a aussi les matières organiques qui proviennent du cycle de décomposition des végétaux et des animaux.
Une eau souterraine peut ainsi contenir des particules filamenteuses, présenter une odeur ou un goût parfois désagréable.
Dans les eaux superficielles, une prolifération bactérienne peut voir le jour. Mais l'eau peut encore subir une modification de ses caractéristiques par :

• les eaux acides pas minéralisées entraînent les corrosions des installations de distribution d'eau et détériorent la qualité de l'eau
• le calcaire qui entartre les circuits d'eau chaude
• les rejets industriels, urbains ou agricoles

Pour toutes ces raisons, les captages destinés à l'eau potable sont étroitement surveillés et la qualité de l'eau distribuée très régulièrement contrôlée.
La pollution de l'eau est une altération qui rend son utilisation dangereuse et qui perturbe aussi l'écosystème du milieu.
Elle peut altérer les eaux superficielles (rivières, plans d'eau) et ou les eaux souterraines. Et ces pollutions peuvent survenir à la suite d'un incident chimique ou domestique, d'une négligence, d'un virus ou d'une bactérie.
Le secteur agricole pollue aussi les cours d'eau en utilisant notamment des pesticides.