Quinze espèces de poissons d'eau douce sur... 69 sont menacées de disparition en France métropolitaine, selon une étude de l'Union internationale pour la conservation de la nature et du Muséum national d'histoire naturelle. 
 
Les causes : la destruction de son milieu naturel et la pollution

- L'extraction de granulats abîme l'habitat de la lamproie (classée dans la catégorie "vulnérable") qui privilégie les cours d'eau à galets pour sa reproduction.
- L'assèchement ou le curage des zones humides bouleversent l'habitat de la loche d'étang ("en danger").
- Le drainage agricole des prairies humides réduit les périodes de crue et affecte la reproduction du brochet ("vulnérable").

- Les barrages compromettent le périple migratoire vers leurs zones de reproduction du saumon de l'atlantique ("vulnérable") et de l'esturgeon européen ("en danger critique d'extinction").
- La pollution et les pesticides fragilisent les défenses immunitaires de l'anguille européenne et affectent la fécondité du chabot du lez, deux espèces classées "en danger critique d'extinction".
- Pour l'anguille européenne, la pêche pourtant réglementée, reste un facteur de menace, aggravé  par un braconnage important lié au coût élevé de ses alevins (civelles).
- Concernant l'esturgeon européen, sa pêche est strictement interdite mais il demeure victime de "captures accidentelles", notamment lors du chalutage en mer, souligne l'UNion internationale pour la conservation de la nature.